Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rbm20Q3UQS8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rbm20Q3UQS8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm20Q3UQS8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm20Q3UQS8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbm20Q3UQS8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rbm20Q3UQS8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbm20Q3UQS8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbm20Q3UQS8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm20Q3UQS8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbm20Q3UQS8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbm20Q3UQS8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbm20Q3UQS8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rbm20Q3UQS8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rbm20Q3UQS8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rbm20Q3UQS8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbm20Q3UQS8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rbm20Q3UQS8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbm20Q3UQS8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbm20Q3UQS8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rbm20Q3UQS8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rbm20Q3UQS8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rbm20Q3UQS8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rbm20Q3UQS8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rbm20Q3UQS8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rbm20Q3UQS8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbm20Q3UQS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rbm20Q3UQS8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rbm20Q3UQS8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbm20Q3UQS8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rbm20Q3UQS8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm20Q3UQS8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rbm20Q3UQS8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rbm20Q3UQS8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rbm20Q3UQS8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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