Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cog7Q3UM29 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cog7Q3UM29 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cog7Q3UM29 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cog7Q3UM29 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cog7Q3UM29 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cog7Q3UM29 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cog7Q3UM29 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cog7Q3UM29 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cog7Q3UM29 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cog7Q3UM29 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cog7Q3UM29 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cog7Q3UM29 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cog7Q3UM29 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cog7Q3UM29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cog7Q3UM29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cog7Q3UM29 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cog7Q3UM29 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cog7Q3UM29 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cog7Q3UM29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cog7Q3UM29 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cog7Q3UM29 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cog7Q3UM29 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cog7Q3UM29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cog7Q3UM29 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cog7Q3UM29 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cog7Q3UM29 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cog7Q3UM29 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cog7Q3UM29 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cog7Q3UM29 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cog7Q3UM29 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog7Q3UM29 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cog7Q3UM29 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cog7Q3UM29 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cog7Q3UM29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms