Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pin1rt1Q3ULQ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pin1rt1Q3ULQ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pin1rt1Q3ULQ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pin1rt1Q3ULQ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms