Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctsll3Q3ULP7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ctsll3Q3ULP7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ctsll3Q3ULP7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctsll3Q3ULP7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctsll3Q3ULP7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctsll3Q3ULP7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctsll3Q3ULP7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctsll3Q3ULP7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctsll3Q3ULP7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctsll3Q3ULP7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctsll3Q3ULP7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctsll3Q3ULP7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctsll3Q3ULP7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctsll3Q3ULP7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctsll3Q3ULP7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctsll3Q3ULP7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctsll3Q3ULP7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctsll3Q3ULP7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctsll3Q3ULP7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctsll3Q3ULP7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ctsll3Q3ULP7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ctsll3Q3ULP7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ctsll3Q3ULP7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ctsll3Q3ULP7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctsll3Q3ULP7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms