Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc177Q3UHB8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc177Q3UHB8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc177Q3UHB8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc177Q3UHB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc177Q3UHB8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc177Q3UHB8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc177Q3UHB8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc177Q3UHB8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc177Q3UHB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc177Q3UHB8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc177Q3UHB8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc177Q3UHB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc177Q3UHB8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc177Q3UHB8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc177Q3UHB8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc177Q3UHB8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc177Q3UHB8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc177Q3UHB8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc177Q3UHB8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc177Q3UHB8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms