Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc58Q3UGP9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc58Q3UGP9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc58Q3UGP9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc58Q3UGP9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc58Q3UGP9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc58Q3UGP9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc58Q3UGP9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrrc58Q3UGP9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc58Q3UGP9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc58Q3UGP9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc58Q3UGP9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc58Q3UGP9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc58Q3UGP9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc58Q3UGP9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc58Q3UGP9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrc58Q3UGP9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrc58Q3UGP9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc58Q3UGP9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrc58Q3UGP9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc58Q3UGP9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc58Q3UGP9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc58Q3UGP9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2057.7 ms