Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nom1Q3UFM5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nom1Q3UFM5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nom1Q3UFM5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nom1Q3UFM5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nom1Q3UFM5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nom1Q3UFM5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nom1Q3UFM5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nom1Q3UFM5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Nom1Q3UFM5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nom1Q3UFM5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nom1Q3UFM5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nom1Q3UFM5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nom1Q3UFM5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nom1Q3UFM5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nom1Q3UFM5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nom1Q3UFM5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nom1Q3UFM5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nom1Q3UFM5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nom1Q3UFM5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nom1Q3UFM5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nom1Q3UFM5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nom1Q3UFM5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nom1Q3UFM5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nom1Q3UFM5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nom1Q3UFM5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nom1Q3UFM5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nom1Q3UFM5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nom1Q3UFM5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nom1Q3UFM5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nom1Q3UFM5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nom1Q3UFM5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nom1Q3UFM5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nom1Q3UFM5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nom1Q3UFM5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nom1Q3UFM5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms