Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5Q7

Cmpk2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk2Q3U5Q7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmpk2Q3U5Q7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmpk2Q3U5Q7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmpk2Q3U5Q7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmpk2Q3U5Q7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmpk2Q3U5Q7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmpk2Q3U5Q7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmpk2Q3U5Q7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cmpk2Q3U5Q7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cmpk2Q3U5Q7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cmpk2Q3U5Q7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cmpk2Q3U5Q7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cmpk2Q3U5Q7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cmpk2Q3U5Q7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cmpk2Q3U5Q7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmpk2Q3U5Q7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmpk2Q3U5Q7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmpk2Q3U5Q7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmpk2Q3U5Q7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cmpk2Q3U5Q7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmpk2Q3U5Q7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmpk2Q3U5Q7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmpk2Q3U5Q7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cmpk2Q3U5Q7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmpk2Q3U5Q7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmpk2Q3U5Q7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmpk2Q3U5Q7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmpk2Q3U5Q7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmpk2Q3U5Q7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmpk2Q3U5Q7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmpk2Q3U5Q7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmpk2Q3U5Q7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms