Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VwceQ3U515 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VwceQ3U515 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VwceQ3U515 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VwceQ3U515 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VwceQ3U515 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VwceQ3U515 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VwceQ3U515 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VwceQ3U515 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VwceQ3U515 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VwceQ3U515 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VwceQ3U515 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VwceQ3U515 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VwceQ3U515 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VwceQ3U515 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VwceQ3U515 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VwceQ3U515 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VwceQ3U515 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VwceQ3U515 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VwceQ3U515 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VwceQ3U515 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VwceQ3U515 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VwceQ3U515 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VwceQ3U515 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VwceQ3U515 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VwceQ3U515 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VwceQ3U515 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VwceQ3U515 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VwceQ3U515 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VwceQ3U515 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VwceQ3U515 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VwceQ3U515 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VwceQ3U515 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VwceQ3U515 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VwceQ3U515 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms