Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C4

Secisbp2, MCG1271, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2Q3U1C4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Secisbp2Q3U1C4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Secisbp2Q3U1C4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Secisbp2Q3U1C4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Secisbp2Q3U1C4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Secisbp2Q3U1C4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Secisbp2Q3U1C4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Secisbp2Q3U1C4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Secisbp2Q3U1C4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Secisbp2Q3U1C4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Secisbp2Q3U1C4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Secisbp2Q3U1C4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Secisbp2Q3U1C4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Secisbp2Q3U1C4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Secisbp2Q3U1C4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Secisbp2Q3U1C4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Secisbp2Q3U1C4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Secisbp2Q3U1C4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Secisbp2Q3U1C4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Secisbp2Q3U1C4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Secisbp2Q3U1C4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2Q3U1C4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Secisbp2Q3U1C4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2Q3U1C4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Secisbp2Q3U1C4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms