Protein–RNA interactions for Protein: Q3U095

Nxpe2, NXPE family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe2Q3U095 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nxpe2Q3U095 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe2Q3U095 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe2Q3U095 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe2Q3U095 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nxpe2Q3U095 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nxpe2Q3U095 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nxpe2Q3U095 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nxpe2Q3U095 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nxpe2Q3U095 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nxpe2Q3U095 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nxpe2Q3U095 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nxpe2Q3U095 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nxpe2Q3U095 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nxpe2Q3U095 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nxpe2Q3U095 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms