Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdkl4Q3TZA2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdkl4Q3TZA2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdkl4Q3TZA2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdkl4Q3TZA2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdkl4Q3TZA2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdkl4Q3TZA2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdkl4Q3TZA2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdkl4Q3TZA2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkl4Q3TZA2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkl4Q3TZA2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms