Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gdpd4Q3TT99 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gdpd4Q3TT99 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gdpd4Q3TT99 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gdpd4Q3TT99 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gdpd4Q3TT99 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gdpd4Q3TT99 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gdpd4Q3TT99 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gdpd4Q3TT99 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gdpd4Q3TT99 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gdpd4Q3TT99 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gdpd4Q3TT99 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gdpd4Q3TT99 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gdpd4Q3TT99 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gdpd4Q3TT99 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gdpd4Q3TT99 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gdpd4Q3TT99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gdpd4Q3TT99 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gdpd4Q3TT99 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gdpd4Q3TT99 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gdpd4Q3TT99 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gdpd4Q3TT99 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gdpd4Q3TT99 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gdpd4Q3TT99 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms