Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Uri1Q3TLD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uri1Q3TLD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uri1Q3TLD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uri1Q3TLD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uri1Q3TLD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uri1Q3TLD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Uri1Q3TLD5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Uri1Q3TLD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Uri1Q3TLD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uri1Q3TLD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uri1Q3TLD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uri1Q3TLD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Uri1Q3TLD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uri1Q3TLD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Uri1Q3TLD5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Uri1Q3TLD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Uri1Q3TLD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Uri1Q3TLD5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Uri1Q3TLD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Uri1Q3TLD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Uri1Q3TLD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Uri1Q3TLD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms