Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Xlr4cQ3TKR2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Xlr4cQ3TKR2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xlr4cQ3TKR2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Xlr4cQ3TKR2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr4cQ3TKR2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Xlr4cQ3TKR2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Xlr4cQ3TKR2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xlr4cQ3TKR2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xlr4cQ3TKR2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xlr4cQ3TKR2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Xlr4cQ3TKR2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xlr4cQ3TKR2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xlr4cQ3TKR2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms