Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDK6

Rogdi, Protein rogdi homolog, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RogdiQ3TDK6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RogdiQ3TDK6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RogdiQ3TDK6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RogdiQ3TDK6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RogdiQ3TDK6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RogdiQ3TDK6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RogdiQ3TDK6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RogdiQ3TDK6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RogdiQ3TDK6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RogdiQ3TDK6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RogdiQ3TDK6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RogdiQ3TDK6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RogdiQ3TDK6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RogdiQ3TDK6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RogdiQ3TDK6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RogdiQ3TDK6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RogdiQ3TDK6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RogdiQ3TDK6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RogdiQ3TDK6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RogdiQ3TDK6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RogdiQ3TDK6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RogdiQ3TDK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RogdiQ3TDK6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RogdiQ3TDK6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RogdiQ3TDK6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RogdiQ3TDK6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RogdiQ3TDK6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RogdiQ3TDK6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RogdiQ3TDK6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RogdiQ3TDK6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RogdiQ3TDK6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RogdiQ3TDK6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RogdiQ3TDK6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RogdiQ3TDK6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RogdiQ3TDK6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms