Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Patl1Q3TC46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Patl1Q3TC46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Patl1Q3TC46 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Patl1Q3TC46 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Patl1Q3TC46 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Patl1Q3TC46 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Patl1Q3TC46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Patl1Q3TC46 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Patl1Q3TC46 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Patl1Q3TC46 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Patl1Q3TC46 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Patl1Q3TC46 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl1Q3TC46 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Patl1Q3TC46 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Patl1Q3TC46 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Patl1Q3TC46 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Patl1Q3TC46 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Patl1Q3TC46 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms