Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Jmjd8Q3TA59 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd8Q3TA59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Jmjd8Q3TA59 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Jmjd8Q3TA59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd8Q3TA59 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Jmjd8Q3TA59 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Jmjd8Q3TA59 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Jmjd8Q3TA59 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd8Q3TA59 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Jmjd8Q3TA59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd8Q3TA59 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Jmjd8Q3TA59 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Jmjd8Q3TA59 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Jmjd8Q3TA59 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Jmjd8Q3TA59 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd8Q3TA59 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd8Q3TA59 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Jmjd8Q3TA59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd8Q3TA59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Jmjd8Q3TA59 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Jmjd8Q3TA59 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Jmjd8Q3TA59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Jmjd8Q3TA59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms