Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdss2Q33DR3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdss2Q33DR3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdss2Q33DR3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdss2Q33DR3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdss2Q33DR3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdss2Q33DR3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdss2Q33DR3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdss2Q33DR3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdss2Q33DR3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdss2Q33DR3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdss2Q33DR3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdss2Q33DR3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss2Q33DR3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdss2Q33DR3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss2Q33DR3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss2Q33DR3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss2Q33DR3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss2Q33DR3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdss2Q33DR3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdss2Q33DR3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 743.2 ms