Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtl9Q32KG4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rtl9Q32KG4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rtl9Q32KG4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rtl9Q32KG4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl9Q32KG4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rtl9Q32KG4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtl9Q32KG4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rtl9Q32KG4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rtl9Q32KG4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rtl9Q32KG4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rtl9Q32KG4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rtl9Q32KG4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rtl9Q32KG4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rtl9Q32KG4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtl9Q32KG4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl9Q32KG4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl9Q32KG4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtl9Q32KG4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtl9Q32KG4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtl9Q32KG4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rtl9Q32KG4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rtl9Q32KG4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rtl9Q32KG4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtl9Q32KG4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rtl9Q32KG4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rtl9Q32KG4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtl9Q32KG4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rtl9Q32KG4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms