Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cd300lgQ1ERP8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cd300lgQ1ERP8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cd300lgQ1ERP8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cd300lgQ1ERP8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cd300lgQ1ERP8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cd300lgQ1ERP8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cd300lgQ1ERP8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cd300lgQ1ERP8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cd300lgQ1ERP8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd300lgQ1ERP8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd300lgQ1ERP8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd300lgQ1ERP8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd300lgQ1ERP8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd300lgQ1ERP8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd300lgQ1ERP8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cd300lgQ1ERP8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd300lgQ1ERP8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd300lgQ1ERP8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cd300lgQ1ERP8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd300lgQ1ERP8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd300lgQ1ERP8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd300lgQ1ERP8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd300lgQ1ERP8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cd300lgQ1ERP8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd300lgQ1ERP8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd300lgQ1ERP8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd300lgQ1ERP8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd300lgQ1ERP8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd300lgQ1ERP8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd300lgQ1ERP8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd300lgQ1ERP8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd300lgQ1ERP8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd300lgQ1ERP8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.5 ms