Protein–RNA interactions for Protein: Q18PI6

Cd84, SLAM family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd84Q18PI6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd84Q18PI6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd84Q18PI6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd84Q18PI6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd84Q18PI6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd84Q18PI6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd84Q18PI6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd84Q18PI6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd84Q18PI6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd84Q18PI6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd84Q18PI6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd84Q18PI6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cd84Q18PI6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cd84Q18PI6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cd84Q18PI6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd84Q18PI6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms