Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smim24Q0VG18 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smim24Q0VG18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim24Q0VG18 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smim24Q0VG18 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smim24Q0VG18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smim24Q0VG18 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smim24Q0VG18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smim24Q0VG18 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smim24Q0VG18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smim24Q0VG18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smim24Q0VG18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smim24Q0VG18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smim24Q0VG18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smim24Q0VG18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smim24Q0VG18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smim24Q0VG18 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smim24Q0VG18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim24Q0VG18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smim24Q0VG18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms