Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
StumQ0VBF8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
StumQ0VBF8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
StumQ0VBF8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
StumQ0VBF8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
StumQ0VBF8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StumQ0VBF8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StumQ0VBF8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
StumQ0VBF8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
StumQ0VBF8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
StumQ0VBF8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
StumQ0VBF8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
StumQ0VBF8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
StumQ0VBF8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
StumQ0VBF8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
StumQ0VBF8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
StumQ0VBF8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
StumQ0VBF8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
StumQ0VBF8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
StumQ0VBF8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
StumQ0VBF8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms