Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pglyrp4Q0VB07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pglyrp4Q0VB07 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pglyrp4Q0VB07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pglyrp4Q0VB07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pglyrp4Q0VB07 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pglyrp4Q0VB07 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pglyrp4Q0VB07 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms