Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAY3

Fam187b, Protein FAM187B, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam187bQ0VAY3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam187bQ0VAY3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam187bQ0VAY3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam187bQ0VAY3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam187bQ0VAY3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam187bQ0VAY3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam187bQ0VAY3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam187bQ0VAY3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam187bQ0VAY3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam187bQ0VAY3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam187bQ0VAY3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam187bQ0VAY3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam187bQ0VAY3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam187bQ0VAY3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam187bQ0VAY3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam187bQ0VAY3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam187bQ0VAY3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam187bQ0VAY3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam187bQ0VAY3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam187bQ0VAY3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam187bQ0VAY3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam187bQ0VAY3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam187bQ0VAY3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam187bQ0VAY3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam187bQ0VAY3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam187bQ0VAY3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam187bQ0VAY3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms