Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Spata18Q0P557 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Spata18Q0P557 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Spata18Q0P557 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Spata18Q0P557 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Spata18Q0P557 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Spata18Q0P557 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Spata18Q0P557 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Spata18Q0P557 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Spata18Q0P557 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Spata18Q0P557 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Spata18Q0P557 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Spata18Q0P557 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Spata18Q0P557 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Spata18Q0P557 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Spata18Q0P557 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Spata18Q0P557 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Spata18Q0P557 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Spata18Q0P557 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Spata18Q0P557 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Spata18Q0P557 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Spata18Q0P557 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Spata18Q0P557 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Spata18Q0P557 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Spata18Q0P557 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Spata18Q0P557 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Spata18Q0P557 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Spata18Q0P557 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Spata18Q0P557 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Spata18Q0P557 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Spata18Q0P557 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Spata18Q0P557 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Spata18Q0P557 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Spata18Q0P557 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Spata18Q0P557 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Spata18Q0P557 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Spata18Q0P557 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Spata18Q0P557 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Spata18Q0P557 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Spata18Q0P557 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Spata18Q0P557 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Spata18Q0P557 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Spata18Q0P557 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Spata18Q0P557 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Spata18Q0P557 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Spata18Q0P557 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Spata18Q0P557 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Spata18Q0P557 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Spata18Q0P557 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Spata18Q0P557 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Spata18Q0P557 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms