Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gdf9Q07105 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gdf9Q07105 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gdf9Q07105 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gdf9Q07105 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gdf9Q07105 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gdf9Q07105 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gdf9Q07105 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gdf9Q07105 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdf9Q07105 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gdf9Q07105 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdf9Q07105 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gdf9Q07105 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdf9Q07105 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gdf9Q07105 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdf9Q07105 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdf9Q07105 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdf9Q07105 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdf9Q07105 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gdf9Q07105 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms