Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SrstQ06666 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SrstQ06666 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SrstQ06666 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrstQ06666 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SrstQ06666 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrstQ06666 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrstQ06666 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrstQ06666 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrstQ06666 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrstQ06666 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrstQ06666 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrstQ06666 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SrstQ06666 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrstQ06666 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms