Protein–RNA interactions for Protein: Q05915

Gch1, GTP cyclohydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gch1Q05915 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gch1Q05915 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gch1Q05915 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gch1Q05915 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gch1Q05915 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gch1Q05915 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gch1Q05915 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gch1Q05915 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gch1Q05915 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gch1Q05915 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gch1Q05915 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gch1Q05915 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gch1Q05915 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gch1Q05915 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gch1Q05915 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms