Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Fmn1Q05860 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Fmn1Q05860 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
Fmn1Q05860 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Fmn1Q05860 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Fmn1Q05860 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
Fmn1Q05860 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
Fmn1Q05860 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Fmn1Q05860 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Fmn1Q05860 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Fmn1Q05860 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
Fmn1Q05860 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Fmn1Q05860 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Fmn1Q05860 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
Fmn1Q05860 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
Fmn1Q05860 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Fmn1Q05860 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Fmn1Q05860 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Fmn1Q05860 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Fmn1Q05860 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Fmn1Q05860 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC43■■■■■ 4.47
Fmn1Q05860 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
Fmn1Q05860 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
Fmn1Q05860 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
Fmn1Q05860 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
Fmn1Q05860 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC42.94■■■■■ 4.47
Fmn1Q05860 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Fmn1Q05860 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Fmn1Q05860 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Fmn1Q05860 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Fmn1Q05860 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Fmn1Q05860 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Fmn1Q05860 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Fmn1Q05860 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
Fmn1Q05860 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Fmn1Q05860 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Fmn1Q05860 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Fmn1Q05860 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Fmn1Q05860 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Fmn1Q05860 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
Fmn1Q05860 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
Fmn1Q05860 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
Fmn1Q05860 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Fmn1Q05860 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
Fmn1Q05860 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
Fmn1Q05860 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Fmn1Q05860 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Fmn1Q05860 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Fmn1Q05860 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Fmn1Q05860 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC42.63■■■■■ 4.42
Fmn1Q05860 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Fmn1Q05860 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Fmn1Q05860 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Fmn1Q05860 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
Fmn1Q05860 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Fmn1Q05860 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Fmn1Q05860 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Fmn1Q05860 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Fmn1Q05860 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Fmn1Q05860 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Fmn1Q05860 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Fmn1Q05860 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Fmn1Q05860 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Fmn1Q05860 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
Fmn1Q05860 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Fmn1Q05860 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Fmn1Q05860 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Fmn1Q05860 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Fmn1Q05860 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Fmn1Q05860 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Fmn1Q05860 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Fmn1Q05860 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Fmn1Q05860 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Fmn1Q05860 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
Fmn1Q05860 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms