Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk7Q03147 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk7Q03147 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk7Q03147 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk7Q03147 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk7Q03147 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk7Q03147 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk7Q03147 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk7Q03147 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk7Q03147 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk7Q03147 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdk7Q03147 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdk7Q03147 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdk7Q03147 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk7Q03147 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdk7Q03147 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdk7Q03147 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdk7Q03147 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk7Q03147 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk7Q03147 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdk7Q03147 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk7Q03147 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdk7Q03147 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdk7Q03147 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdk7Q03147 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk7Q03147 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdk7Q03147 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk7Q03147 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cdk7Q03147 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdk7Q03147 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk7Q03147 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk7Q03147 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cdk7Q03147 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdk7Q03147 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdk7Q03147 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk7Q03147 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdk7Q03147 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdk7Q03147 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms