Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp10Q000W5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gbp10Q000W5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbp10Q000W5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbp10Q000W5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gbp10Q000W5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gbp10Q000W5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp10Q000W5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gbp10Q000W5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbp10Q000W5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbp10Q000W5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp10Q000W5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp10Q000W5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gbp10Q000W5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp10Q000W5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp10Q000W5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp10Q000W5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp10Q000W5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp10Q000W5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp10Q000W5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp10Q000W5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gbp10Q000W5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp10Q000W5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms