Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shc1P98083 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Shc1P98083 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Shc1P98083 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Shc1P98083 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shc1P98083 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shc1P98083 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc1P98083 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc1P98083 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shc1P98083 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shc1P98083 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shc1P98083 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shc1P98083 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shc1P98083 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shc1P98083 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shc1P98083 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Shc1P98083 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shc1P98083 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shc1P98083 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shc1P98083 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shc1P98083 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shc1P98083 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shc1P98083 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Shc1P98083 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc1P98083 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shc1P98083 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shc1P98083 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms