Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cry1P97784 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cry1P97784 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cry1P97784 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cry1P97784 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cry1P97784 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cry1P97784 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cry1P97784 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cry1P97784 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry1P97784 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cry1P97784 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cry1P97784 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cry1P97784 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cry1P97784 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cry1P97784 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cry1P97784 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cry1P97784 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cry1P97784 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cry1P97784 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cry1P97784 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry1P97784 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry1P97784 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cry1P97784 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry1P97784 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cry1P97784 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cry1P97784 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cry1P97784 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cry1P97784 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cry1P97784 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cry1P97784 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cry1P97784 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cry1P97784 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cry1P97784 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cry1P97784 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms