Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Meis3P97368 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Meis3P97368 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Meis3P97368 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Meis3P97368 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Meis3P97368 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Meis3P97368 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Meis3P97368 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Meis3P97368 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Meis3P97368 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Meis3P97368 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Meis3P97368 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Meis3P97368 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Meis3P97368 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Meis3P97368 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Meis3P97368 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Meis3P97368 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Meis3P97368 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Meis3P97368 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Meis3P97368 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Meis3P97368 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Meis3P97368 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Meis3P97368 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Meis3P97368 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Meis3P97368 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Meis3P97368 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Meis3P97368 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Meis3P97368 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Meis3P97368 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Meis3P97368 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Meis3P97368 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Meis3P97368 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Meis3P97368 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Meis3P97368 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Meis3P97368 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Meis3P97368 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms