Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1aP97357 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Taf1aP97357 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1aP97357 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1aP97357 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Taf1aP97357 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1aP97357 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Taf1aP97357 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1aP97357 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Taf1aP97357 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1aP97357 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1aP97357 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Taf1aP97357 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Taf1aP97357 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Taf1aP97357 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf1aP97357 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf1aP97357 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf1aP97357 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1aP97357 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1aP97357 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1aP97357 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1aP97357 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms