Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SmsP97355 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SmsP97355 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SmsP97355 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SmsP97355 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SmsP97355 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SmsP97355 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SmsP97355 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SmsP97355 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SmsP97355 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SmsP97355 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SmsP97355 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SmsP97355 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SmsP97355 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SmsP97355 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SmsP97355 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SmsP97355 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SmsP97355 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SmsP97355 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SmsP97355 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SmsP97355 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SmsP97355 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SmsP97355 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SmsP97355 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SmsP97355 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SmsP97355 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SmsP97355 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SmsP97355 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SmsP97355 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SmsP97355 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SmsP97355 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SmsP97355 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SmsP97355 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SmsP97355 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SmsP97355 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SmsP97355 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SmsP97355 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SmsP97355 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SmsP97355 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SmsP97355 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SmsP97355 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SmsP97355 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SmsP97355 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SmsP97355 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SmsP97355 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SmsP97355 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SmsP97355 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SmsP97355 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SmsP97355 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SmsP97355 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmsP97355 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SmsP97355 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SmsP97355 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SmsP97355 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SmsP97355 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SmsP97355 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SmsP97355 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SmsP97355 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SmsP97355 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SmsP97355 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SmsP97355 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SmsP97355 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SmsP97355 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SmsP97355 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SmsP97355 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SmsP97355 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SmsP97355 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SmsP97355 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SmsP97355 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SmsP97355 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SmsP97355 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SmsP97355 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SmsP97355 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmsP97355 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SmsP97355 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SmsP97355 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SmsP97355 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SmsP97355 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SmsP97355 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SmsP97355 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SmsP97355 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SmsP97355 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SmsP97355 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SmsP97355 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SmsP97355 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SmsP97355 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SmsP97355 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SmsP97355 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SmsP97355 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SmsP97355 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SmsP97355 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SmsP97355 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SmsP97355 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SmsP97355 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SmsP97355 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SmsP97355 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmsP97355 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmsP97355 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SmsP97355 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SmsP97355 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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