Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vgll3P85442 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vgll3P85442 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vgll3P85442 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vgll3P85442 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vgll3P85442 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vgll3P85442 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vgll3P85442 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vgll3P85442 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vgll3P85442 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Vgll3P85442 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vgll3P85442 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vgll3P85442 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Vgll3P85442 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vgll3P85442 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vgll3P85442 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vgll3P85442 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vgll3P85442 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vgll3P85442 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vgll3P85442 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms