Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SgcdP82347 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SgcdP82347 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SgcdP82347 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SgcdP82347 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SgcdP82347 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SgcdP82347 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SgcdP82347 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SgcdP82347 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SgcdP82347 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SgcdP82347 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SgcdP82347 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SgcdP82347 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SgcdP82347 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SgcdP82347 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SgcdP82347 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SgcdP82347 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SgcdP82347 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SgcdP82347 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SgcdP82347 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SgcdP82347 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SgcdP82347 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgcdP82347 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SgcdP82347 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SgcdP82347 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SgcdP82347 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SgcdP82347 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SgcdP82347 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SgcdP82347 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SgcdP82347 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgcdP82347 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgcdP82347 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SgcdP82347 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SgcdP82347 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgcdP82347 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms