Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fgf11P70378 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fgf11P70378 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fgf11P70378 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fgf11P70378 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgf11P70378 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fgf11P70378 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgf11P70378 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fgf11P70378 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fgf11P70378 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fgf11P70378 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fgf11P70378 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fgf11P70378 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgf11P70378 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgf11P70378 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgf11P70378 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgf11P70378 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgf11P70378 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgf11P70378 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgf11P70378 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgf11P70378 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgf11P70378 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgf11P70378 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgf11P70378 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgf11P70378 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgf11P70378 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgf11P70378 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgf11P70378 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgf11P70378 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgf11P70378 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgf11P70378 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgf11P70378 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgf11P70378 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgf11P70378 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgf11P70378 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgf11P70378 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgf11P70378 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fgf11P70378 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fgf11P70378 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgf11P70378 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgf11P70378 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgf11P70378 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgf11P70378 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fgf11P70378 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fgf11P70378 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fgf11P70378 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms