Protein–RNA interactions for Protein: P70365

Ncoa1, Nuclear receptor coactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa1P70365 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ncoa1P70365 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ncoa1P70365 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Ncoa1P70365 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Ncoa1P70365 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ncoa1P70365 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Ncoa1P70365 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ncoa1P70365 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ncoa1P70365 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ncoa1P70365 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ncoa1P70365 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ncoa1P70365 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ncoa1P70365 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ncoa1P70365 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ncoa1P70365 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
Ncoa1P70365 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ncoa1P70365 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ncoa1P70365 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ncoa1P70365 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ncoa1P70365 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Ncoa1P70365 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ncoa1P70365 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ncoa1P70365 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ncoa1P70365 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Ncoa1P70365 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Ncoa1P70365 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Ncoa1P70365 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Ncoa1P70365 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ncoa1P70365 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ncoa1P70365 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ncoa1P70365 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ncoa1P70365 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
Ncoa1P70365 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ncoa1P70365 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ncoa1P70365 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ncoa1P70365 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ncoa1P70365 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ncoa1P70365 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Ncoa1P70365 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Ncoa1P70365 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ncoa1P70365 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ncoa1P70365 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ncoa1P70365 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Ncoa1P70365 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ncoa1P70365 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
Ncoa1P70365 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ncoa1P70365 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ncoa1P70365 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ncoa1P70365 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Ncoa1P70365 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Ncoa1P70365 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ncoa1P70365 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ncoa1P70365 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ncoa1P70365 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Ncoa1P70365 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ncoa1P70365 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Ncoa1P70365 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Ncoa1P70365 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ncoa1P70365 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ncoa1P70365 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.5 ms