Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sema3eP70275 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sema3eP70275 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sema3eP70275 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sema3eP70275 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sema3eP70275 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sema3eP70275 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sema3eP70275 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sema3eP70275 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sema3eP70275 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sema3eP70275 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sema3eP70275 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sema3eP70275 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sema3eP70275 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sema3eP70275 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sema3eP70275 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sema3eP70275 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sema3eP70275 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sema3eP70275 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sema3eP70275 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema3eP70275 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sema3eP70275 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema3eP70275 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema3eP70275 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sema3eP70275 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sema3eP70275 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sema3eP70275 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sema3eP70275 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema3eP70275 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema3eP70275 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema3eP70275 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sema3eP70275 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sema3eP70275 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sema3eP70275 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sema3eP70275 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sema3eP70275 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sema3eP70275 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema3eP70275 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sema3eP70275 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Sema3eP70275 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sema3eP70275 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Sema3eP70275 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sema3eP70275 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sema3eP70275 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sema3eP70275 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sema3eP70275 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sema3eP70275 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sema3eP70275 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sema3eP70275 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sema3eP70275 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sema3eP70275 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sema3eP70275 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms