Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb4bP68372 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubb4bP68372 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb4bP68372 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb4bP68372 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb4bP68372 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb4bP68372 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubb4bP68372 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tubb4bP68372 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubb4bP68372 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubb4bP68372 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tubb4bP68372 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb4bP68372 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tubb4bP68372 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tubb4bP68372 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tubb4bP68372 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb4bP68372 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tubb4bP68372 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tubb4bP68372 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tubb4bP68372 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tubb4bP68372 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb4bP68372 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tubb4bP68372 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb4bP68372 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb4bP68372 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb4bP68372 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb4bP68372 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb4bP68372 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tubb4bP68372 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb4bP68372 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms