Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tuba4aP68368 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tuba4aP68368 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba4aP68368 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba4aP68368 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tuba4aP68368 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tuba4aP68368 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tuba4aP68368 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tuba4aP68368 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tuba4aP68368 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tuba4aP68368 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tuba4aP68368 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tuba4aP68368 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tuba4aP68368 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tuba4aP68368 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tuba4aP68368 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tuba4aP68368 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tuba4aP68368 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tuba4aP68368 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tuba4aP68368 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tuba4aP68368 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tuba4aP68368 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tuba4aP68368 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tuba4aP68368 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms