Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csnk2bP67871 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csnk2bP67871 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csnk2bP67871 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csnk2bP67871 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csnk2bP67871 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csnk2bP67871 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csnk2bP67871 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csnk2bP67871 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Csnk2bP67871 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Csnk2bP67871 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csnk2bP67871 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csnk2bP67871 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk2bP67871 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk2bP67871 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2bP67871 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2bP67871 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2bP67871 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2bP67871 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms