Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnb1P62874 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnb1P62874 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gnb1P62874 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gnb1P62874 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnb1P62874 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gnb1P62874 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gnb1P62874 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gnb1P62874 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gnb1P62874 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms