Protein–RNA interactions for Protein: P62627

Dynlrb1, Dynein light chain roadblock-type 1, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dynlrb1P62627 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dynlrb1P62627 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dynlrb1P62627 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dynlrb1P62627 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dynlrb1P62627 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dynlrb1P62627 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dynlrb1P62627 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dynlrb1P62627 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dynlrb1P62627 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dynlrb1P62627 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dynlrb1P62627 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dynlrb1P62627 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dynlrb1P62627 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dynlrb1P62627 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dynlrb1P62627 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dynlrb1P62627 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dynlrb1P62627 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dynlrb1P62627 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dynlrb1P62627 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dynlrb1P62627 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dynlrb1P62627 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dynlrb1P62627 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dynlrb1P62627 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms