Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps29P62274 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rps29P62274 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps29P62274 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rps29P62274 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps29P62274 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rps29P62274 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rps29P62274 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rps29P62274 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps29P62274 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps29P62274 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps29P62274 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps29P62274 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps29P62274 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps29P62274 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps29P62274 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps29P62274 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rps29P62274 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps29P62274 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rps29P62274 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps29P62274 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rps29P62274 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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