Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d1P61080 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d1P61080 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2d1P61080 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ube2d1P61080 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2d1P61080 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube2d1P61080 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d1P61080 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d1P61080 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms